Genetic characterisation of Langerin gene in human immunodeficiency virus-1-infected women from Bahia, Brazil

Studies on human genetic variations are a useful source of knowledge about human immunodeficiency virus (HIV)-1 infection. The Langerin protein, found at the surface of Langerhans cells, has an important protective role in HIV-1 infection. Differences in Langerin function due to host genetic factors could influence susceptibility to HIV-1 infection. To verify the frequency of mutations in the Langerin gene, 118 samples from HIV-1-infected women and 99 samples from HIV-1-uninfected individuals were selected for sequencing of the promoter and carbohydrate recognition domain (CRD)-encoding regions of the Langerin gene. Langerin promoter analysis revealed two single nucleotide polymorphisms (SNPs) and one mutation in both studied groups, which created new binding sites for certain transcription factors, such as NFAT5, HOXB9.01 and STAT6.01, according to MatInspector software analysis. Three SNPs were observed in the CRD-encoding region in HIV-1-infected and uninfected individuals: p.K313I, c.941C>T and c.983C>T. This study shows that mutations in the Langerin gene are present in the analysed populations at different genotypic and allelic frequencies. Further studies should be conducted to verify the role of these mutations in HIV-1 susceptibility.

Mutações na região LTR do HTLV e sua implicação na presença do vírus na saliva e origem na Bahia / Mutations in the LTR region of HTLV and its implication in the presence of virus in saliva and origin in Bahia

O HTLV-1 é o agente etiológico da ATL, HAM/TSP e outras perturbações inflamatórias. Alguns estudos tentam analisar as variações do HTLV-1 em diferentes fluidos corpóreos e seu impacto sobre a infecção pelo HTLV. A coinfecção HTLV/HIV-1 é associada com graves manifestações clínicas, imunodeficiência marcante e infecções oportunistas, bem como comportamento de risco. Salvador, capital do Estado da Bahia, Brasil, tem a maior prevalência para o HTLV-1 (1,74%) encontrada no país. Poucos estudos descrevem esta coinfecção em Salvador e áreas vizinhas, e muito menos investigam como estes vírus circulam ou avaliam a relação entre eles. Para descrever a epidemiologia molecular do HTLV-1 e as características da coinfecção HTLV/HIV-1 em mulheres, nós realizamos um corte transversal envolvendo 107 mulheres infectadas com HIV-1 do centro de referência da DST/HIV/AIDS, localizado na cidade de Feira de Santana. Amostras das pacientes foram testadas por ELISA e a infecção pelo HTLV confirmada usando o WB e PCR.A análise filogenética foi realizada nas seqüências LTR do HTLV para obter mais informações sobre a epidemiologia molecular e a origem deste vírus na Bahia. Quatro das cinco amostras reativas no ELISA foram confirmadas como HTLV-1 no WB e PCR e uma amostra confirmada como HTLV-2. A soroprevalência da infecção pelo HTLV nestas mulheres foi de 4,7%, menor que o esperado, provavelmente pela baixa prevalência da infecção pelo HTLV esta área ou devido a medidas de controle de DST/AIDS implementadas desde a realização do estudo anterior. A análise filogenética, comparando clones de lavado bucal e PBMC, não mostrou nenhum perfil clonal entre os indivíduos com carga proviral detectada em células do lavado bucal e também não mostrou significância estatística no teste de Hudson. A diversidade genética, entre os clones de PBMC e lavado bucal variou de 0,003 a 0,008083 O perfil de sítios de modificação pós-traducional no fragmento de tax analisado foi equivalente entre os grupos analisados. Todas as seqüências analisadas foram classificadas como subgrupo transcontinental do subtipo Cosmopolita.